基因工程(英语:Gene engineering)又称遗传工程(英语:Genetic engineering)[注 1]、基因操作、基因修饰、重组核酸技术,是一种使用生物技术直接操纵有机体基因组、用于改变细胞遗传物质的工程;此工程技术可以通过使用分子克隆技术分离和复制需要的遗传物质以产生核酸序列,也可以借由生物工程学方法设计并合成核酸序列,然后以此“外源DNA或RNA”将新的遗传物质插入宿主基因组中,使同一物种或跨物种的基因转移,以产生改良的或新的生物体。
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