癌症干细胞（英语：Cancer Stem Cell，简称：CSC），又称癌干细胞、肿瘤干细胞，是指具有干细胞性质的癌细胞，也就是具有“自我复制”（self-renewal）以及“具有多细胞分化”（differentiation）等能力。通常这类的细胞被认为有形成肿瘤，发展成癌症的潜力，特别是随着癌症转移出去后，产生新型癌症的来源。

肿瘤内许多的细胞，其实只有一群细胞具有永生不死、持续分裂、分化的能力，而这些细胞，就称为癌症干细胞。

癌症干细胞的疗法

癌症干细胞被认为是造成癌症转移、复发，或是肿瘤对于化疗、放射性疗法产生抗性的原因之一。目前针对这个理论，学者希望研究出针对癌症干细胞的疗法，能够专一性地杀死癌症干细胞，以降低肿瘤产生抗药性或是转移的现象。

目前的癌症疗法都是基于动物实验的结果，目前的认知是只要癌症疗法能将动物身上的肿瘤有效地缩小，就会被认为有其疗效，然而要将实验结果对照到人体医疗上仍有相当大的差距。比如说，以小鼠为例，生活周期很难超过两年，如此短的生活周期无法提供癌症复发的动物模型可供研究。

而癌症干细胞的理论认为，因为现行的治疗都无法专一性的针对癌症干细胞，而癌症干细胞在肿瘤里其实只占一小部分，只要化疗、放射性疗法没有杀死所有的癌症干细胞，就会有抗药性或是复发的风险出现。